Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOP08100 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOP08100 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOP08100 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms