Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAVP06756 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms