Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEBLO76041 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEBLO76041 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEBLO76041 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEBLO76041 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEBLO76041 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEBLO76041 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms