Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN11O75508 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CLDN11O75508 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN11O75508 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN11O75508 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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