Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms