Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KDELR3O43731 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KDELR3O43731 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KDELR3O43731 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms