Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms