Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEMP2A6NFY4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NEMP2A6NFY4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms