Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD54BQ9Y620 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD54BQ9Y620 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms