Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRPRBQ9Y5M8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRBQ9Y5M8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms