Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNPO3Q9Y5L0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms