Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PHLDA3Q9Y5J5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHLDA3Q9Y5J5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms