Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB2Q9Y5E7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB2Q9Y5E7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB2Q9Y5E7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms