Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB4Q9Y5E5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms