Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB5Q9Y5E4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms