Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF1Q9Y548 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF1Q9Y548 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF1Q9Y548 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms