Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL11Q9Y3B7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL11Q9Y3B7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL11Q9Y3B7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms