Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC1Q9Y3B2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC1Q9Y3B2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms