Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRG3Q9Y2Y8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRG3Q9Y2Y8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRG3Q9Y2Y8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms