Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V0

C15orf41, Uncharacterized protein C15orf41, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41Q9Y2V0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C15orf41Q9Y2V0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms