Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms