Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms