Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2B3Q9UQQ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms