Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN8AQ9UQD0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN8AQ9UQD0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN8AQ9UQD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms