Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAF8Q9UPN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAF8Q9UPN6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms