Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX6Q9UNH7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX6Q9UNH7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX6Q9UNH7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms