Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX7Q9UNH6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX7Q9UNH6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.2 ms