Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4EQ9ULY5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLEC4EQ9ULY5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLEC4EQ9ULY5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4EQ9ULY5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms