Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCC3Q9ULS5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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TMCC3Q9ULS5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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TMCC3Q9ULS5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TMCC3Q9ULS5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TMCC3Q9ULS5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TMCC3Q9ULS5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TMCC3Q9ULS5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMCC3Q9ULS5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMCC3Q9ULS5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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