Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA2Q9UL42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNMA2Q9UL42 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA2Q9UL42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms