Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCE2Q9UKZ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCOLCE2Q9UKZ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms