Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO4Q9UKT5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO4Q9UKT5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO4Q9UKT5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms