Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM4Q9UKN5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM4Q9UKN5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM4Q9UKN5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms