Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCTPQ9UKL6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PCTPQ9UKL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCTPQ9UKL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms