Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315 ms