Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMP5Q9UJQ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMP5Q9UJQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms