Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HACL1Q9UJ83 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HACL1Q9UJ83 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HACL1Q9UJ83 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms