Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSRAQ9UJ68 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSRAQ9UJ68 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms