Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA1Q9UIW2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLXNA1Q9UIW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA1Q9UIW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms