Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX4Q9UIU6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX4Q9UIU6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms