Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP25Q9UHP3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP25Q9UHP3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP25Q9UHP3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms