Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCF20Q9UGU0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCF20Q9UGU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCF20Q9UGU0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms