Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1LQ9UGC7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1LQ9UGC7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms