Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX1-2Q9UD57 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX1-2Q9UD57 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX1-2Q9UD57 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms