Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM8A1Q9UBU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM8A1Q9UBU6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM8A1Q9UBU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms