Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS29Q9UBQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS29Q9UBQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 586.4 ms