Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARGC1AQ9UBK2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms