Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK-18Q9QC07 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-18Q9QC07 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-18Q9QC07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms