Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGAP28Q9P2N2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGAP28Q9P2N2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms