Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRBP1Q9P2E9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
RRBP1Q9P2E9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
RRBP1Q9P2E9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRBP1Q9P2E9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.5 ms